La prise en charge des patients doit se faire dans un centre spécialisé dans l’accueil des douleurs thoraciques.
Le diagnostic de myocardite aiguë étant souvent difficile électriquement et biologiquement, il est essentiel de ne pas manquer un syndrome coronaire aigu. Une coronarographie en urgence est souvent réalisée.
Un coroscanner peut être réalisé, en particulier chez les patients à probabilité pré test basse, pour son excellente valeur prédictive négative.
Son intérêt réside principalement dans l’étude du ventricule gauche : fonction contractile segmentaire et globale, épaisseur myocardique.
L'IRM, avec étude de l'œdème et du rehaussement tardif après injection de chélate de gadolinium, est l'examen clé du diagnostic, permettant également d’éliminer comme diagnostic différentiel l’infarctus du myocarde. Cet examen n’est pas une urgence mais il doit être réalisé rapidement (<48H) car les signes de myocardite disparaissent dans les 10 jours dans un nombre important de cas.